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6種類目のゲノム由来ヌクレオシド 5-hmdC
2'-デオキシ-5-(ヒドロキシメチル)シチジン(5-hmdC)とその塩基部分5-ヒドロキシメチルシトシン (5-hmC) は2'-デオキシ-5-メチルシチジン(5-mdC)の酸化生成物で,哺乳類(特に幹細胞)のDNAでその存在が最近確認されました。2'-デオキシシチジン(dC)の塩基部5位メチル化体である5-mdCは,エピジェネティクス研究におけるDNAメチル化の指標とされてきました。一方5-hmdCは,幹細胞のDNA脱メチル化経路において中間体としての役割を担っていると推測されていますが,未だ不明な点が多く残されています。その役割解明のため,ゲノム中の5-hmdCの検出する研究は現在も続けられています。
文献
- The Discovery of 5-Formylcytosine in Embryonic Stem Cell DNA
- 5-Hydroxymethylcytosine, the Sixth Base of the Genome (Minireview)
- 5-Hydroxymethylcytosine Is Strongly Depleted in Human Cancers but Its Levels Do Not Correlate with IDH1 Mutations
- Determination of genomic 5-hydroxymethyl-2'-deoxycytidine in human DNA by capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence
- Discrimination between 5-hydroxymethylcytosine and 5-methylcytosine in DNA by selective chemical labeling
- Deamination, Oxidation, and C–C Bond Cleavage Reactivity of 5-Hydroxymethylcytosine, 5-Formylcytosine, and 5-Carboxycytosine