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TCI应用实例：使用DCI进行核苷的亚磷酰胺化反应

我们很荣幸地向您介绍以DCI为活化剂进行5'-O-苯甲酰胸苷的亚磷酰胺化反应。

使用的化学品

• 5'-O-Benzoylthymidine (1)
• 2-Cyanoethyl N,N,N',N'-Tetraisopropylphosphordiamidite [C2228]
• 4,5-Dicyanoimidazole (= DCI) [D2026]
• DMF
• Acetonitrile

步骤

在氮气保护下，向2-氰乙基 N,N,N',N'-四异丙基亚磷酰二胺 (0.42 g, 1.4 mmol)和DCI (0.14 g, 1.2 mmol)的乙腈 (2 mL)溶液中加入1 (0.40 g, 1.2 mmol)的DMF溶液。在室温下，搅拌反应混合物过夜，然后用TBME稀释，并依次用水，DMF:H₂O (1:1)溶液，水和饱和食盐水洗涤。减压浓缩有机层。所得粗产物通过硅胶柱层析 (己烷:乙酸乙酯:三乙胺 = 1:2:0.03)纯化，得到白色粉末2 (0.45 g, 收率68%)。

实验者评价

通过LCMS监测反应混合物。

分析数据

化合物 2

¹H NMR (400 MHz, DMSO-d6); δ 11.36 (brs, 1H), 8.05-7.96 (m, 2H), 7.73-7.64 (m, 1H), 7.59-7.51 (m, 2H), 7.45-7.37 (m, 1H), 6.25-6.17 (m, 1H), 4.72-4.62 (m, 1H), 4.62-4.52 (m, 1H), 4.51-4.38 (m, 1H), 4.32-4.15 (m, 1H), 3.84-3.66 (m, 2H), 3.66-3.51 (m, 2H), 2.84-2.73 (m, 2H), 2.47-2.22 (m, 2H), 1.67-1.53 (m, 3H), 1.27-1.03 (m, 12H).

¹³C NMR (101 MHz, DMSO-d6); δ 165.5, 163.6, 150.4, 135.8, 133.7, 129.3 (3C), 128.9 (2C), 119.0, 109.9, 84.1, 82.8, 72.8, 64.9, 58.3 (2C), 42.7, 37.7, 24.3 (4C), 19.8, 11.9.

³¹P NMR (162 MHz, DMSO-d6); δ 147.89.

主要参考文献

• Efficient activation of nucleoside phosphoramidites with 4,5-dicyanoimidazole during oligonucleotide synthesis
  • C. Vargeese, J. Carter, J. Yegge, S. Krivajansky, A. Settle, E. Kropp, K. Peterson, W. Pieken, Nucleic Acids Res. 1998, 26, 1046.